Tógadh é in acadamh óige Boavista, agus thosaigh Fernandes a ghairm bheatha ghairmiúil in 2012, ag imirt do chlubanna Iodálach ar nós Novara, Udinese, agus Sampdoria, áit ar fhorbair sé a chuid scileanna i lár na páirce. Bhí seal ríthábhachtach ag a ghairm bheatha in 2017 nuair a chuaigh sé isteach i Sporting CP, agus bhuaigh sé gradaim Primeira Liga Player of the Season i ndiaidh a chéile. Shocraigh sé taifead do na himreoirí lár páirce le 32 cúl agus 18 gcúnamh i séasúr amháin, rud a thug ar an bhfoireann téarnamh tar éis ionsaí foréigneach lucht leanúna ar an talamh traenála.
I mí Eanáir 2020, d’aistrigh Fernandes go Manchester United ar €55 milliún, rud a d’éirigh go han-tapa mar bhunchloch na foirne. Sa chéad leath den séasúr, thaifead sé 8 gcúilín agus 7 gcúnamh, ag socrú taifead an Premier League don fheidhmíocht is fearr trí shíniú geimhridh. Ainmníodh é mar Imreoir an tséasúir ag Manchester United ar feadh dhá bhliain as a chéile agus roghnaíodh é ar Fhoireann na Bliana PFA. Mar chaptaen, léirigh sé tiomantas ollmhór, ag fanacht leis an gclub ar feadh tréimhse neamh-chomhsheasmhachta agus ag diúltú do thairiscint conartha €200 milliún ó chlubanna na hAraibe Sádaí chun tacú le hath-thógáil United. In 2025, shroich sé an chloch mhíle de 100 sprioc do Manchester United, ag éirí leis an 23ú imreoir i stair an chlub chun an t-éacht seo a bhaint amach, agus chabhraigh sé leis an bPortaingéil teideal Sraith na Náisiún UEFA a bhuachan arís.
Ar an bpáirc, nascann Fernandes cumas súgartha le críochnú cliniciúil. Tá 98 cúl bailithe aige agus 86 cabhraíonn sé le 290 láithreas do Manchester United, agus bhuaigh sé gradam Assist King i Sraith na Seaimpíní UEFA le 7 gcúnamh i séasúr 2021-22. Ar an 16 Nollaig, 2025, scóráil sé cic saor agus chuir sé cúnamh ar fáil i gcluiche a bhuaigh Manchester United 4-4 le Bournemouth, ag tuilleamh onóracha Man of the Match agus ag leanúint ar aghaidh ag cuimsiú "spiorad Red Devil" trína chuid léirithe.
